1994年11月，化学与化学工程学院在化学系、高分子研究所和材料科学研究所的基础上组建成立。随着丰盛堂的建设和启用，学院办学条件得到明显改善，学科发展生机勃勃。2016年8月，学院更名为化学学院。2020年，广州校区东校园化学材料综合楼启用。在学校的大力支持下，学院进入新一轮快速发展时期。化学入选国家“双一流”建设学科，跻身世界前列。新的百年征程之际，学院将坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，落实立德树人的根本任务，努力建设中国特色世界一流化学学科。

1994年11月，化学与化学工程学院成立。随着丰盛堂一期、二期的建设，学院办学条件得到明显改善。

化学实验教学中心于2000年5月成立，2006年4月被教育部批准为首批国家级实验教学示范中心。

2016年8月，化学与化学工程学院更名为化学学院。2020年东校园化学材料综合楼启用。

在科技奖励方面，学院迄今已牵头荣获国际奖5项，国家奖14项，其中国家自然科学二等奖3项。

中山大学绿色化学与分子工程研究院成立于2022年7月6日，为校级实体科研机构，依托单位为化学学院，联合校内相关学院与研究单位共建，下设三中心两平台（基础研究中心、应用研究中心、技术创新中心、莱恩功能材料研究所国际合作平台、仪器共享平台）。2023年立项建设首批广东省高等学校基础研究卓越中心。